Auto-entrepreneur : faut-il vraiment engager un expert-comptable en 2025 ?

L’auto-entreprise, aussi appelée micro-entreprise, attire chaque année des milliers d’indépendants séduits par sa souplesse administrative. Mais une question revient systématiquement au moment de lancer son activité : faut-il engager un expert-comptable ? En 2025, la réponse légale reste inchangée : non, ce n’est pas obligatoire. Cependant, en fonction de l’évolution de votre activité, de vos ambitions ou de votre aisance avec les démarches administratives, le recours à un professionnel peut devenir utile, voire nécessaire.

NEOVI est un cabinet d’expertise comptable digital spécialisé dans l’accompagnement des freelances et indépendants. Grâce à une plateforme intuitive et un expert-comptable dédié, NEOVI simplifie la gestion comptable, fiscale et sociale tout en optimisant la performance financière des entrepreneurs.

Nous passons en revue les obligations comptables du micro-entrepreneur, le rôle que peut jouer un expert-comptable, les alternatives disponibles, et les situations concrètes où il devient intéressant de déléguer sa comptabilité.

Quel régime comptable pour un auto-entrepreneur ?

Le régime de la micro-entreprise est conçu pour limiter au maximum les contraintes administratives. Voici ce que vous devez faire sans forcément passer par un professionnel.

• Tenir un livre des recettes, à jour, avec les montants encaissés, les dates, les noms des clients, les modes de paiement et les numéros de facture.
• Tenir un registre des achats uniquement si vous vendez des marchandises ou proposez des prestations d’hébergement.
• Émettre des factures conformes aux mentions obligatoires (identité, date, TVA éventuelle, prix…).
• Déclarer votre chiffre d’affaires chaque mois ou trimestre sur le site de l’URSSAF.
• Ouvrir un compte bancaire dédié si votre chiffre d’affaires dépasse 10 000 € deux années de suite.
• Conserver vos justificatifs pendant 10 ans : factures, relevés, registres.
• Franchise de TVA : si vous restez en dessous des seuils de chiffre d’affaires (77 700 € en prestations, 188 700 € en vente), vous n’avez ni TVA à facturer, ni déclaration à déposer.

 Conclusion : dans la majorité des cas, un auto-entrepreneur peut gérer seul ses obligations comptables.

L’expert-comptable : pour quoi faire ?

Même si la loi n’impose rien, le recours à un expert-comptable peut répondre à plusieurs besoins, selon le contexte de votre activité.

a) Suivi quotidien de l’activité

• Contrôle de la régularité de vos déclarations de chiffre d’affaires et de TVA.
• Alerte en cas de dépassement de seuils (TVA ou passage à un autre régime fiscal).
• Vérification des factures, registres, justificatifs : conformité aux normes légales.

b) Accompagnement stratégique

• Aide en cas de développement ou changement de statut (passage en EI, EURL, SASU…).
• Optimisation fiscale, conseil sur les cotisations sociales ou le passage à la TVA.
• Préparation à un éventuel contrôle URSSAF ou fiscal.

c) Gestion de situations complexes

• Rédaction des conditions générales de vente, assistance aux démarches AGA ou ACRE.
• Constitution de dossiers de financement ou de subvention.
• Aide à la création d’une société ou à l’organisation d’une cession d’activité.

 L’expert-comptable est un partenaire stratégique quand l’activité dépasse la simple gestion autonome.

Expert-comptable ou logiciel de comptabilité ?

Logiciels spécialisés (Indy, Freebe, Quickbooks…)

• Automatisent la saisie des dépenses et recettes à partir de votre compte bancaire.
• Génèrent des factures conformes, et facilitent leur archivage.
• Aident à remplir les déclarations URSSAF en quelques clics.
• Alertent en cas de dépassement des seuils de chiffre d’affaires.
• Sécurisent vos données grâce à des systèmes de chiffrement et de sauvegarde.

• Tarif moyen : entre 10 € et 40 € par mois.

• Avantages : autonomie, coût réduit, simplicité.

• Limites : pas de conseil fiscal personnalisé, pas d’assistance en cas de contrôle.

Expert-comptable (en cabinet ou en ligne)

• Prend en charge les déclarations, le suivi fiscal, la comptabilité globale.
• Apporte des conseils personnalisés selon votre activité.
• Peut vous représenter ou vous assister en cas de contrôle ou de contentieux.

Coût annuel : entre 350 € et 800 € HT pour une mission classique. Plus en cas de prestations spécifiques.

• Avantages : expertise, accompagnement, tranquillité d’esprit.
• Limite : budget plus élevé à prévoir.

À quel moment envisager un expert-comptable ?

En phase de lancement

Si vous débutez, que votre activité est simple et vos revenus modestes, un logiciel suffit largement. Vous pouvez tout gérer vous-même à condition d’un minimum de rigueur.

En phase de croissance ou de transition

Lorsque le chiffre d’affaires approche les plafonds de la micro-entreprise, ou si vous souhaitez basculer en société, un expert-comptable devient conseillé :

• Suivi de TVA, tenue de bilans comptables, création de tableaux de bord…
• Conseil sur la transition vers un autre régime fiscal ou social.
• Optimisation des charges déductibles, planification de vos investissements.

Pour des projets ou situations complexes

Vous avez besoin d’un crédit bancaire, vous êtes confronté à un contrôle fiscal, ou vous souhaitez mettre en place une stratégie patrimoniale ? L’expert-comptable devient un allié indispensable.

Que choisir selon votre profil ?

Précautions pour bien choisir son expert-comptable

Avant de signer un contrat, voici quelques conseils utiles :

• Vérifiez l’inscription à l’Ordre des experts-comptables.
• Comparez plusieurs devis : durée de mission, tarifs, fréquence des échanges.
• Évaluez les outils utilisés : certains cabinets proposent une plateforme connectée.
• Posez des questions sur l’accompagnement : est-il réactif ? spécialisé en indépendants ? adapté à votre secteur ?

En 2025, l’auto-entrepreneur conserve toute sa liberté en matière de comptabilité. Si vous êtes à l’aise avec les outils numériques, un logiciel de gestion peut suffire amplement à remplir vos obligations. Mais dès que la complexité s’invite — chiffre d’affaires élevé, contrôle URSSAF, transition vers un autre statut — le regard d’un expert-comptable devient un atout.

À vous de choisir : autonomie, économie et flexibilité ou accompagnement, sécurité et conseils ciblés. L’essentiel est de maîtriser vos obligations et d’anticiper les évolutions de votre activité.